Les gouvernements vous permettent de personnaliser votre civilisation en fonction de votre style de jeu : ils vous offrent différentes combinaisons d'emplacements pour choisir divers types de doctrines et octroient des bonus.
Les différents types de gouvernement sont débloqués via l'arbre des dogmes au fil du temps. Au commencement, vous ne disposerez que d'un gouvernement sommaire avec peu d'emplacements, mais à mesure que vous progresserez dans le temps et la partie, vous débloquerez plus d'emplacements et de combinaisons. De plus, les gouvernements octroient des bonus spécifiques ; la théocratie, par exemple, vous permet d'acheter des unités terrestres avec de la foi, tout en réduisant le prix des achats avec de la foi.
Enfin, tous les gouvernements octroient des bonus transmis en fonction de leur durée dans votre empire. Par exemple, même si vous avez abandonné la théocratie pour un modèle plus récent, son bonus transmis réduira vos dépenses en foi en fonction de la durée de ce gouvernement dans l'histoire de votre empire. Vous pouvez changer de gouvernement à tout moment. Si vous revenez à un type de gouvernement précédent, votre civilisation se trouvera en proie à l'anarchie.